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恶意的程序：大家最熟悉的恶意程序就是病毒，很多人认为病毒对数据的影响仅仅是病毒的破坏性，这是不正确的，实际上病毒的感染本身就是一种破坏，一个病毒无论他借助修改你的引导区、可执行程序还是OFFICE文档，他都把你正常的数据做了改变，当然，你可能举良性伴随性病毒这种极端的例子。但毫无疑问，他同样对数据构成了破坏，至少他减少了你的硬盘的可用空间。同时，恶意的程序还包括特洛伊木马，逻辑炸弹等等。恶意的程序造成的破坏可能是最难恢复的。
其他恶意的破坏，即使不借助病毒或者其他的工具，只要拥有足够的权限，任何系统都有一定的“自毁”能力。比如依靠系统正常的删除、移动、格式化等操作也可以达到破坏数据的目的。随着网络技术的发展，威胁已经不仅仅限于本机。
NDD：常见的FAT文件结构磁盘修复工具，就是著名的NORTON磁盘医生，可以自动修复分区丢失等情况，可以抢救软盘坏区中的数据，强制读出后搬移到其他空白扇区。希望大家不要再使用NORTON FOR DOS7或8的NDD，这个版本由于不支持大分区、FAT32、长文件名等技术，会给你带来大量的麻烦。建议大家使用Norton Utilities4或更高版本中的NDD.EXE，这是纯DOS下的工具。在硬盘崩溃或异常的情况下，他可能可以带给用户以希望。WIN9X下的磁盘医生调用的并不是这个程序，而是NDD32.EXE。
硬盘坏：硬盘自检不到的情况一般是硬件故障，又可分为主版的硬盘控制器（包括IDE口）故障和硬盘本身的故障。如果问题在主板上，那么数据应当没有影响。如果出在硬盘上，也不是一定不能修复。硬盘可能的故障又可能在控制电路、电机和磁头以及盘片。如果是控制电路的问题，一般修好它，就可以读出数据。但如果电机、磁头和盘片故障，即使修理也要返回原厂，数据恢复基本没有可操作性。